抢跑疫情二代技能缩短病毒基因测序时刻

本报记者 阎俏如 北京报导

武汉肺炎疫情持续延伸的一起，相关科研作业正在紧锣密鼓地进行。

2020年1月10日，上海市公共卫生临床中心和公共卫生学院与华中科技大学武汉市中心医院、武汉市疾病防备操控中心、国家流行症防备操控所、我国疾病防备操控中心和澳大利亚悉尼大学协作，公开了2019冠状病毒基因组。

经数据剖析，2019-nCoV与2003年迸发的SARS病毒基因组序列类似度为80%，与2017年2月从国内的蝙蝠中收集到的Bat SARS-like coronavirus isolate bat-SL-CoVZC45基因组序列类似性最高，类似度为88%。对2019-nCoV病毒株的基因组变异剖析为追溯病毒来历、追寻病毒株变异途径、防控新式冠状病毒引发的疫情、医治病毒性肺炎供给重要的数据根底与决议计划支撑。

1月11日，国家卫健委发布音讯，武汉不明原因的病毒性肺炎疫情遭到各界广泛重视，为保护全球卫生安全，我国将与世界卫生组织共享武汉不明原因的病毒性肺炎病例中检测到的新式冠状病毒基因序列信息。

与2003年形成“非典”疫情的SARS病毒比较，此次2019冠状病毒基因测序完结的时刻大大缩短。

恒瑞源正首席科学家周向军博士向《我国经营报》记者介绍，2003年，SARS病毒基因测序运用的是第一代技能，此次2019冠状病毒测序运用的是第二代技能Next Generation Sequencing（NGS），比较于第一代技能，第二代技能测序完结愈加快速、精确。

2002年12月，“非典”病例开端呈现，2003年4月13日，加拿大一间实验室首先宣告破译了SARS病毒序列。2003年5月1日，美国《科学》杂志刊登了两份“非典”病毒基因组序列研讨论文。由美国和加拿大研讨人员组成的两个研讨小组在论文中证明，“非典”病毒是一种全新的冠状病毒。

比较之下，此次新式冠状病毒疫情从通签到基因组被破译仅用时10天。周向军介绍，病毒基因序列关于检测、快速确诊、疫苗研制和药品研制都具有重要意义。

新式冠状病毒基因序列发布后，国内从事流行症检测的体外确诊职业公司敏捷布局研制，现已先后有多家公司宣告推出新式冠状病毒检测产品。

1月22日，国家卫生健康委办公厅和国家中医药管理局办公室联合印发《新式冠状病毒感染的肺炎治疗计划（试行第三版）》。关于病例的界说，该治疗计划清晰，一起契合流行病学史（即发病前两周内有武汉市游览史或寓居史；或发病前14天内从前触摸过来自武汉的发热伴有呼吸道症状的患者，或有集合性发病）和临床表现为发热；具有肺炎印象学特征；发病前期白细胞总数正常或下降，或淋巴细胞计数削减，能够判别为疑似病例。

契合疑似病例规范的根底上，痰液、咽拭子、下呼吸道分泌物等标本进行实时荧光RT-PCR检测新式冠状病毒核酸阳性；或病毒基因测序，与已知的新式冠状病毒高度同源，则判别为确诊病例。

北京市一家新式肺炎救治定点医院的专家向记者介绍，现在北京市医疗机构对新式肺炎患者的确诊流程是，患者到医疗机构就诊后，医师依据上述治疗计划判别患者是否为疑似病例。将疑似病例阻隔后，将患者的痰液、咽拭子、下呼吸道分泌物等标本送至各辖区疾控中心进行实时荧光RT-PCR检测，通过专家会诊，确认是否为确诊病例。因为核酸检测试剂盒刚刚研制成功，现在暂时还未下发到医院。

RT-PCR即逆转录PCR，是聚合酶链式反响的一种大范围的使用的变形。聚合酶链式反响作为一种分子生物学技能，能够完结DNA片段的扩增作业，它最杰出的优势便是能够脱离生物，在生物体外展开DNA的仿制作业，而且能够将少量、微量的DNA进行很大程度的扩增。

核酸检测PCR试剂盒中含有聚合酶链式反响所需求的各种试剂组分，PCR反响液混合液中参加检测样品，即可进行PCR扩增反响。PCR扩增产品经琼脂糖电泳染色判别，阳性样本将在相应巨细的片段处呈现特异性条带，从而对感染样本进行确诊。

上述专家指出，新年期间，广大群众要防止到电影院等人流集合的当地，其患病危险非常大。现在新年档电影现已悉数撤档。此前，新年档电影预售票房现已超越2亿元，从专家视点考虑，这一状况关于新式肺炎防控具有很大危险。

（修改：曹学平 校正：颜京宁）